Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCDHA7Q9UN72 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCDHA7Q9UN72 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms