Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX12Q9UMY4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SNX12Q9UMY4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms