Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EPDR1Q9UM22 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EPDR1Q9UM22 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms