Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DENND2AQ9ULE3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
DENND2AQ9ULE3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms