Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH7Q9ULB5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms