Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAPPC2LQ9UL33 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAPPC2LQ9UL33 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms