Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GTF3C4Q9UKN8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms