Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PILRAQ9UKJ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PILRAQ9UKJ1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms