Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCAN3Q9UKA8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RCAN3Q9UKA8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RCAN3Q9UKA8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms