Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNL1Q9UK58 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNL1Q9UK58 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNL1Q9UK58 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNL1Q9UK58 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNL1Q9UK58 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNL1Q9UK58 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms