Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MSRAQ9UJ68 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MSRAQ9UJ68 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms