Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPXQ9UHP9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SMPXQ9UHP9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms