Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL13Q9P2N7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms