Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
HCN3Q9P1Z3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HCN3Q9P1Z3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms