Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KCMF1Q9P0J7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KCMF1Q9P0J7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms