Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF12Q9NZN5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
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