Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSD3Q9NYI0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSD3Q9NYI0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms