Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FANCLQ9NW38 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms