Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RBM28Q9NW13 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM28Q9NW13 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms