Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV88

INTS9, Integrator complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS9Q9NV88 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
INTS9Q9NV88 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.32■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.31■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
INTS9Q9NV88 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms