Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATG3Q9NT62 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms