Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMPRSS4Q9NRS4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMPRSS4Q9NRS4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms