Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PAPOLBQ9NRJ5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PAPOLBQ9NRJ5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms