Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL28Q9NRJ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms