Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRAC1Q9NRG0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRAC1Q9NRG0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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