Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARHGEF4Q9NR80 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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