Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPRD1BQ9NQG5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms