Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ASCL3Q9NQ33 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ASCL3Q9NQ33 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms