Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NGRNQ9NPE2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NGRNQ9NPE2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms