Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CBX8Q9HC52 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX8Q9HC52 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms