Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COG4Q9H9E3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COG4Q9H9E3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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