Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7L9

SUDS3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3Q9H7L9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SUDS3Q9H7L9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SUDS3Q9H7L9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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