Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
C8orf33Q9H7E9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C8orf33Q9H7E9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms