Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS3Q9H6R3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACSS3Q9H6R3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms