Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3T3

SEMA6B, Semaphorin-6B, humanhuman

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6BQ9H3T3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA6BQ9H3T3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA6BQ9H3T3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms