Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIOBPQ9H2D6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIOBPQ9H2D6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms