Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIF3L1Q9GZT8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIF3L1Q9GZT8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms