Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM6Q9C030 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM6Q9C030 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms