Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXQ1Q9C009 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXQ1Q9C009 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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