Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NLRP1Q9C000 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NLRP1Q9C000 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms