Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CRNKL1Q9BZJ0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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