Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTPBP4Q9BZE4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTPBP4Q9BZE4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms