Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIFKQ9BYG3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIFKQ9BYG3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms