Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
SCAPERQ9BY12 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SCAPERQ9BY12 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms