Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A5Q9BY07 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A5Q9BY07 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms