Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CACNG6Q9BXT2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CACNG6Q9BXT2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms