Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SALL3Q9BXA9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SALL3Q9BXA9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms