Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF7Q9BWX1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF7Q9BWX1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms