Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIGD2AQ9BW72 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIGD2AQ9BW72 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms