Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSU1

C16orf70, UPF0183 protein C16orf70, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf70Q9BSU1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C16orf70Q9BSU1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C16orf70Q9BSU1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms